Vaikka sekä MOC:t että MOF:t sisältävät metalli{0}}orgaanisia koordinaatiosidoksia, niissä on perustavanlaatuisia eroja:
Ulottuvuus: MOC:t ovat 0-ulotteisia erillisiä molekyylejä, kun taas MOF:t ovat 2D tai 3D äärettömästi laajennettuja verkkoja.
Liukoisuus: Useimmat MOC:t ovat liukoisia, kun taas MOF:t ovat yleensä liukenemattomia.
Vakaus: MOF:illa on yleensä korkeampi lämpöstabiilisuus.
Sovelluspainopiste: MOC:t loistavat molekyylien tunnistamisessa, kun taas MOF:t sopivat paremmin kaasun varastointiin.
